传统的物化-生化务和方法能够去除只要废水中的大部分有机物，几时处理水质达到相应的排放标准。如用与再生回用，则必须深度处理。多年来国内对只要废水深度处理再生回用技术进行了广泛的研发，取得了较大进展主要处理技术有吸附术、氧化技术、生物技术、膜分离技术。

      吸附技术

      在制药废水深度处理方面研究和 应用最广的是活性炭吸附，但存在活性炭吸附易于饱和及再生困难，再生后吸附能力亦有不同程度下降等问题，以此在工程实践中活性炭吸附成本很高。臭氧氧化后活性炭是一种很好的改良方法，研究发现臭氧氧化能延长活性炭再生周期，减少再生费用。由于活性炭不仅是一种吸附质同时也使臭氧氧化的催化剂。臭氧氧化后活性炭吸附可以弥补各自固有的不足具有很好的协同作用。

      氧化技术，

      目前氧化技术在废水再生中利用的应用研究较多，尤其是高级氧化技术、电化学氧化技术和光催化氧化技术。以fenton为代表的高级氧化技术在制药废水深度处理中，脱色效果良好，COD去除率较高。电化学氧化可以有效的去除废水中的色度、浊度及COD，有实验研究表明，电化学氧化深度处理制药废水可以取得良好地效果。光催化虽然处理效果很好，但设备投资和电耗还有待进一步降低，目前还处于小规模应用。

     膜分离技术

     研究表明，将不用的膜分离技术如微滤、超滤、纳滤、反渗透等相结合，或膜分离技术与其他技术相结合（如膜生物反应器），是制药废水深度处理的一个重要研究方向。如采用混凝-砂滤-微滤-反渗透集成技术深度处理抗生素废水的现场试验表明如采用混凝-砂滤-微滤-能有效的去除废水中的悬浮物和浊度，去除部分氨氮和CODcr,降低废水的SDI值，为后续反渗透提供合格的进水，反渗透能去废水中的绝大部分无机盐、色度和CODcr处理水质优于《城市污水再生利用   工业用水水质》中规定的各项控制指标要求。但是膜分离技术存在着投资和运行费用偏高，在运行中易产生膜的污堵，需要高水平的预处理和定期的化学清洗，以及浓缩物的处理等问题，需要在今后的研发和工程实践中予以解决。